印有“东都塔”图案的新版一万日元纸币正式发行，一时间引发社会热议。柯南与少年侦探团、阿笠博士、小兰、园子一同前往日本纸币印刷局长野工厂参观。与此同时，警视厅召集了黑田管理官、目暮、佐藤、高木等搜查一课警员，以及风见裕也等公安部人员。文书鉴定技官里见透子判定，佐藤与高木侦办的杀人案中查获的新版一万日元纸币为假钞，警方随即成立搜查本部。由于这是日本境内发现的第30种伪造纸币，本案被通称为“30号事件”，这批假钞也被命名为“Ultra 30”。新版纸币出现假钞流通——这一史无前例的消息曝光后引发全社会混乱，柯南与平次动身前往疑似印制这批假钞的大阪工厂——另一边，调查触角也延伸至大阪以外的其他纸币工厂。静冈与神奈川县交界处的纸币工厂，由静冈县警横沟参悟、神奈川县警横沟重悟负责；而小兰等人所在的长野与群马县交界的纸币工厂，则集结了长野县警大和敢助、诸伏高明、上原由衣，以及群马县警山村操。面对这场由新版纸币伪造案引发的国家危机，柯南史上最大规模全明星阵容，全力迎战！